反滲透設備清洗時將清洗溶液以低壓大流量在膜的高壓側循環，此時膜元件仍裝在壓力容器內，而且需要專門的清洗裝置來完成該項工作。

反滲透設備反滲透系統的清洗工藝一般步驟：

1、用泵將干凈、無游離氯的反滲透淡水打入壓力容器中，并排放幾分鐘。

2、用反滲透淡水配制清洗液(詳見表二)。

3、將清洗液在壓力容器中循壞1小時或預先設定的時間，對于8英寸壓力容器，流速在35～40加侖/分(8～9m3/H)。

4、藥洗完成后，排凈藥箱剩余液，并進行清洗，然后放入反滲透淡水。

5、用泵將藥箱內淡水打入壓力容器中，并排放幾分鐘。

6、在沖洗反滲透系統后，將反滲透系統的淡水出口排放閥打開，反滲透設備投入正常運行，15-30分鐘后檢查淡水排放水水質(無泡沫、無清洗劑、電導率達標)。

7、將反滲透系統淡水出口閥打開，淡水出口排放閥關閉，反滲透設備恢復正常運行。